SKKK Yogyakarta juga memiliki budaya luhur yang disebut Budaya SMART. Budaya SMART melatih murid-murid untuk berperilaku yang baik dalam kehidupan sehar-hari.
Budaya SMART merupakan singkatan sebagai berikut:
S: senyum, salam, sapa, sopan
M: maaf
A: antre
R: ringkas, rapi, resik, rawat, rajin
T: tolong, terima kasih